El 30 de abril de 1959 mediante la Resolución Nº 300 se crea la Escuela “Nueva Creación de Niñas Nº 1”, la cual el 22 de septiembre del mismo año cambia de nombre a Unidad Educativa Elisa de Ballivián en honor a la reconocida Pintora Boliviana.
La Unidad Educativa Elisa de Ballivián inicialmente prestó servicios educativos a 30 alumnas, bajo la Dirección de la señorita Aida Sujjet, juntamente con un destacado plantel Docente y Administrativo.
En 1997, las autoridades designaron a la profesora Mery Valdez de Peñaranda como directora de la Unidad Educativa, quien fundó los ciclos Intermedio y Medio, completando así todos los niveles de Educación y también realizó el convenio con Escuelas Populares Don Bosco. La Trilogía de Don Bosco “Razón – Religión - Amor” es un llamado a las fuerzas interiores más profundas, vivas y personales que el hombre lleva dentro. “anclados en la esperanza y Peregrinos con los jóvenes”. Con esta visión LA PROFESORA FRESIA PEÑALOZA RÍOS, Lic. AMÉRICO CAHUAYA HUAÑAPACO, LIC. VICTOR DIEGO CRUZ VILLCA y LIC. EDWIN QUENTA CLARES continuaron trabajando en forma tesonera integrándose con las Escuelas Populares “Don Bosco”.
Actualmente en la Unidad Educativa Elisa de Ballivián de convenio funcionan los Niveles de Educación Primaria Comunitaria Vocacional y Secundaria Comunitaria Productiva, contando con 700 estudiantes, 36 Docentes de especialidad y 5 administrativos, quienes son parte muy importante dentro de la Comunidad Educativa, los mismos que por encima de todo, se basan en la sencillez, la confianza, la serenidad y la bondad.
En la gestión 2017 los estudiantes de la Unidad Educativa participaron del Campeonato de Atletismo Infantil en representación del departamento de La Paz, obteniendo uno de los primeros lugares en la etapa nacional.
En la gestión 2018 los estudiantes de la Unidad Educativa obtuvieron medalla de plata en las Olimpiadas Plurinacionales de Bolivia.
El 2021, en las Olimpiadas Científicas Estudiantiles Plurinacional Boliviana los estudiantes de la Unidad Educativa lograron obtener medallas de oro y bronce en las áreas de Matemáticas y Ciencias Sociales respectivamente.
El 28 de febrero de 2023 la Unidad Educativa Elisa de Ballivián recibió Homenaje Camaral por los 59 años de Servicio a la Educación, y Medalla al Mérito Institucional otorgado por la Cámara de Diputados de la Asamblea Legislativa Plurinacional de Bolivia.
El 14 de marzo de 2023 recibió Reconocimiento Parlamentario por Mérito Educativo, otorgado por la Brigada Parlamentaria del Departamento de La Paz.
En el 2024 recibió Reconocimiento por la Asamblea Legislativa por Innovación y Gestión Escolar. Y también el Reconocimiento del Gobierno Autónomo Municipal de La Paz Secretaria de Gestión Ambiental y Energía Renovable por generar hábitos, actitudes y valores al bienestar ambiental.
En la gestión 2024 la Editorial del Estado Plurinacional de Bolivia publica el libro “Elisa de Ballivián” donde se encuentran publicados 8 cuentos escritos por los estudiantes a partir de las memorias familiares.
El 29 de enero del 2025 recibió el Reconocimiento por la Asamblea Legislativa Departamental de La Paz por garantizar el funcionamiento Integral de la Educación.
Actualmente la Unidad Educativa tiene como Directora Institucionalizada a la LIC. XIMENA JANETTE COPA SURCO, quien destaca por su compromiso en bien de los estudiantes, teniendo como visión el desarrollo integral, promoviendo la participación y tolerancia para formar ciudadanos responsables y honestos.